寧夏醫科大學前身是1958年建立的寧夏醫學院。1962年改稱寧夏大學醫學系。1972年，上海鐵道醫學院搬遷至銀川，與寧夏大學醫學系合并重建寧夏醫學院。2002年，寧夏衛生學校、寧夏護士學校并入寧夏醫學院。2008年8月，學校更名為寧夏醫科大學。2014年，寧夏師范學院醫學院并入寧夏醫科大學，至此，寧夏醫科大學成為寧夏唯一一所高等醫學教育學府。
學校有雁湖、雙怡兩個校區。設有13個教學機構，11個教輔科研機構，具有較為完善的大學醫院系統，有12所附屬醫院（直屬附屬醫院2所，直屬附屬專科醫院3所），17所教學醫院，50余所實習醫院和實踐教學基地。其中總醫院是寧夏規模最大的綜合性三級甲等醫院，是區域性的醫療、科研、教育、考試和培訓中心，醫療服務輻射寧夏全區和內蒙、甘肅、陜西等毗鄰地區。附屬回醫中醫醫院是自治區唯一的公立回醫醫院，是國家中醫藥管理局重點建設的三級甲等民族醫醫院。
學校現有教職員工及醫護人員7400余人（含直屬附屬醫院），其中專任教師866人，副高以上職稱674人。教師中有雙聘院士1人，研究生導師532人（其中博士生導師29人）。全日制在校生8927人，其中，博士、碩士研究生1778人，留學生347人。
學校堅持“艱苦創業、自強不息，開放辦學、內涵發展，強化特色、注重創新，全面提高教育質量和效益”的辦學理念，有醫學、理學和管理學3個學科門類，形成了以醫學為主，中西醫并存，多學科協調發展的學科專業體系。開設有21個本科專業，其中臨床醫學、中醫學、預防醫學、護理學、藥學為國家級特色專業，有5個自治區級重點專業群。目前，擁有3個一級學科博士學位授予點，8個一級學科碩士學位授予點，5個專業學位授權單位。2010年成為國家教育體制改革研究生教育改革試點項目高校。
“十二五”以來，學校共承擔各級各類科研項目3353項，其中國家級科研項目444項，研究經費達3.16億元。學校堅持開放辦學理念，重視與國內外高校的交流與合作，先后與15個國家或地區的近30所院校和科研機構建有友好合作關系，廣泛開展人才培養與科研交流合作。
學校依托民族地區優勢，積極開展回醫藥教育與研究，回醫藥逐步形成了科研、教學、臨床及文化交流為一體的辦學特色。
目前，寧夏醫科大學已發展成為一所規模、結構、質量、效益協調發展，在全國同類院校中有一定影響力和知名度的高等醫學院校。“十三五”期間，學校將不斷加強內涵建設，突出辦學特色，提高辦學水平，為實現“兩個一流”（西部一流、有一流學科）和建設西部地區有特色、現代化、高水平的教學科研型醫科大學繼續努力。
